Aprendiendo J2EE ayuda

[oyeca2]

Buenas, estoy empezando a programar en J2EE pero tengo un monton de dudas tengo 2 años programando en php he realizado aplicaciones grandes tambien eh utilizado frameworks, ORM, etc tambien tengo conocimientos de configurar el apache y base de datos pero al empezar con java me surgen varias dudas las cuales espero que me la puedan resolver

1. ¿Que servidor de aplicaciones es recomendable?
Bueno respecto a esto eh visto mucha polemica pero lo que mas me interesa es saber, es que si por ejemplo realizo mi aplicacion con el servidor GlassFish no haya ningun problema si lo cambio a JBoss o a Tomcat, es algo parecido a que si tengo una aplicacion en php esta puede correr tanto en IIS o en Apache sin problema.

2.¿Cual IDE es bueno para usar?

3.¿Es bueno utilizar frameworks o solo basta utilizar servlets y beans?

4.¿Que tanto tiempo me va a demorar aprender a utilizar esta tecnologia? teniendo en cuenta que tengo conceptos basicos lo que pasa que en la universidad lleve un curso y aprendi lo indispensable, pero han salido varias cosas que tengo que aprender

5.¿Algun buen manual para empezar?

Gracias por su tiempo
Saludos