Sería mejor que dejaras que WP lo creara de nuevo, pero esto es lo que wordpress necesita para funcionar:
Código:
# BEGIN WordPress
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . /index.php [L]
</IfModule>
# END WordPress
Quita lo demás, deja solamente esto en el archivo y veamos qué sucede.
Saludos.