Qué raro, pareciera que no está activado el plugin
¿Qué tal algún añadido para cache? quizás estés usando alguno que te haya generado una página que no tiene ese código. Aunque sería un tanto (muy) extraño que ese fuera el caso.
¿Qué versión de wordpress y de WP-Stats estás usando? ¿están ambos actualizados?