Ya te dijo alvlin (
) cuál era tu problema: No podés escribir script así como así dentro de código javascript. En lugar de esto:
Código PHP:
ventana.document.writeln('<script src="jsBotonDerecho.js"></script>');
Podrías usar algo así:
Código PHP:
ventana.document.writeln('<sc'+'ript src="jsBotonDerecho.js"></sc'+'ript>');
De esa manera no aparece dentro del código un tag script.