...pues como yá me había currao la respuesta la dejo igual
Linit, añade esto en el head
<script language="javascript">
function abrirVentana()
{
ancho=(screen.width-480)/2
alto=(screen.height-477)/2
atributos="width=480,height=477,left=" + ancho + ",top=" + alto
ventana= window.open('../encuesta/procesar_enc.php?votar=true','',atributos)
}
</script>
y luego a tu botón le pides...
<input class=boton type="button" value="Votar" name="B1" onClick="abrirVentana()">
Saludos