Yo todo lo que he hecho es en PAL (el de España, que no sé si es B, N o cual

). Mi cámara graba en PAL, edito en PAL, grabo en PAL, mi DVD lee PAL y mi TV también el PAL... vamos, todos con la misma norma, quizá por eso nunca encontré problemas
Lo que te dijeron de pasar de PAL a NTSC es cierto, ten en cuenta que PAL tiene un framerate de 25 cuadros/segundo mientras que NTSC son 30. Eso quiere decir que por cada segundo de vídeo, el programa de conversión se "inventa" (más bien repite) 5 cuadros, de ahí los saltos.
Existe una cosa que se llama pulldown que teóricamente soluciona eso, se usa para pasar vídeos de 23.976 fps a 29.97 fps, pero resulta que el canopus procoder 1.5 (no el 2.0) tiene la opción de hacer un pulldown desde 25 fps, que sería lo que necesitas. Lo malo es que el 1.5 ya está descontinuado y no se compra, aunque sigue funcionando bien y buscando buscando se encuentra...

Para el pulldown te recomiendo que leas en
http://www.mundodivx.com/varios/zonasdvd.php el apartado del canopus, que se explica dónde está la opción.
Si con eso no va... tienes otra posibilidad. El programa DVD#VCD permite convertir AVI a MPG variando el framerate, lo hace a través de avisynth no sé muy bien cómo pero lo hace... también te podría servir. Manual:
www.mundodivx.com/mpeg/dvd2mpg.php
Suerte