David el Grande tiene razon.. utiliza saltos de linea con '\n'... y las concatenaciones en js se hacen con '+' no con '.'
Código HTML:
<textarea id="txtarea">hola jack</textarea>
<script>
alert(document.getElementById('txtarea').innerHTML);
var texto = document.getElementById('txtarea').innerHTML;
document.getElementById('txtarea').innerHTML = texto+'\nbye jack..';
</script>