Hola,
Ok, no estoy completamente seguro ... y ahorita estoy en Linux

Pero creo que Ejecutar -> Examinar no te va a llevar a la carpeta bin.
Tendrías que escribir el Path completo del archivo .java, o entrar al cmd (Símbolo del Sistema), cambiar de directorio a \bin, y desde allí ejecutar javac xxx.
Saludos,