Hola CsC_3:
Lo que yo sé de las ventanas microbians es que son bonitas en explorer, pero se ven igual que cualquier otra ventana en cualquier otro explorador (por eso ni las uso ni las recomiendo, aunque muchos digan que la mayoría de internautas usa explorer, bla, bla... ¿?) y la forma de moverlas tiene que ser exactamente igual que con cualquier explorador (puedo equivocarme)...
con un javascript window.moveTo(x, y)...
Puedes hacer un bucle incrementando x o y (o decreciéndolo) y yastá... Espero que te sirva.
Saludos