Hola Mikil
Una forma de hacerlo es con SQL si lanzás la consulta nuevamente, pidiendo sólo los campos pendientes.
Usando JavaScript es un poco más comlicado, deberías identificar cada TR con un id, y pedirle que te los oculte mediante una función:
<table>
<tr id=a1><td>Hola</td><td>1000</td><td>Pendiente</td></tr>
<tr id=a2><td>Chau</td><td>2000</td><td></td></tr>
<tr id=a3><td>Hola</td><td>3000</td><td>Pendiente</td></tr>
<tr id=a4><td>Chau</td><td>4000</td><td></td></tr>
</table>
<a href="javascript
:pend();">Pend</a>
<script>
function pend() {
if (a2.style.display=="none") {
a2.style.display="block"
a4.style.display="block"
}
else {
a2.style.display="none"
a4.style.display="none"
}
}
</script>
Suerte