Saludos.
Lo que tienes que hacer es descargarter el driver para MySQL, yo uso el siguiente : mysql-connector-java-5.1.7-bin, lo descargas y luego por netbeans, ventana window, opcion services, creas una nueva conexion e insertas el driver. Con esot debes poder trabajar Java + Netbeans. El driver lo puedes descargar de la siguiente dirección:
http://vps238.zoner.fi/trac/wiki/SystemDocumentation.
Buena suerte con este tema