Bien, se me ocurrió un idea, podrías hacerlo con javascript. El código sería así:
Esto iría en el mismo iframe, al final, después de </html>
Código:
<script language="JavaScript">
var lnks = document.getElementsByTagName("a");
for (var i = 0; i < lnks.length; i ++) {
var lnk = lnks[i]
if (lnk.target == '_blank') {
lnk.href = "main.php?url=" + lnk.href;
}
}
</script>
Espero que te sirva.