Dicen que la letra con sangre entra, asi que ahi va:
<body>
<form method=post name='frmListarDoc' action=''><select name='sel1' multiple><option value=''>Seleccionar</option><option value="406">406</option><option value="valor" >Opción</option><option value="406">406</option><option value="valor" >Opción</option><option value="420">420</option><option value="valor" >Opción</option><option value="424">424</option><option value="valor" >Opción</option><option value="587">587</option><option value="valor" >Opción</option><option value="607">607</option><option value="valor" >Opción</option><option value="666">666</option><option value="valor" >Opción</option><option value="777">777</option><option value="valor" >Opción</option><option value="802">802</option><option value="valor" >Opción</option><option value="806">806</option><option value="valor" >Opción</option><option value="809">809</option><option value="valor" >Opción</option><option value="812">812</option><option value="valor" >Opción</option><option value="840">840</option><option value="valor" >Opción</option><option value="864">864</option><option value="valor" >Opción</option><option value="864">864</option><option value="valor" >Opción</option><option value="928">928</option><option value="valor" >Opción</option><option value="928">928</option><option value="valor" >Opción</option><option value="3336">3336</option><option value="valor" >Opción</option><option value="4144">4144</option><option value="valor" >Opción</option><option value="4328">4328</option><option value="valor" >Opción</option><option value="4424">4424</option><option value="valor" >Opción</option><option value="4428">4428</option><option value="valor" >Opción</option><option value="4428">4428</option><option value="valor" >Opción</option></select></td><br><br><input type=text name=txtNombre size=10><input type=hidden name=txtNombre value=''><td align=center colspan=3><button onClick=popUp1('notaCarpetasACiudadela.asp')>Mostr ar Marcado</button></td>
<a href="notaCarpetas.asp" target="popup" onclick="window.open("", "popup", "")" > popup </a>
<br>
<a href="notaCarpetas.asp?txtNombre=" target="popup" onclick="window.open('', 'popup', 'width = 500, height = 500')">Mostrar</a>
</form>
</body>
Y puse lo que me indicaste (Chr(34)) en los options.