No entiendo del todo como es el problema que tienes.
dices: "pagina definida de inicio aparece
http://localhost/ en lugar de aparecer http://localhost/?q="
La pagina de inicio definida en Informacion del sitio no suele ser localhost/?q=
sino acaso localhost/node.
De todas formas, si sigues con problemas, si estas usando Drupal 6 limpia el cache y luego si eso no ha solucionado nada haz lo de update.php que aunque no es para esto a veces soluciona estas cosas.