Hola Merockito,
Para posicionar páginas en Flash, lo mejor es brindarle al buscador contenidos alternativos en html. Esto también es una gran ventaja para la accesibilidad.
Para hacerlo, podés poner los contenidos (exactamente iguales, no spammees porque puede llevarte a penalización) entre etiquetas <noembed> luego del <embed> del flash, o bien inyectar el flash por javascript y utilizar etiquetas <noscript> para mostrar lo alternativo.
Hay otras técnicas bastante más complejas pero muy efectivas, que logran obtener la misma importacia que un sitio html de cara a los buscadores.
Mi favorita es la que aprovecha FlashVars, javascript y <noscript>. Podés
bajar el tutorial de la técnica acá.
Hace poco intercambiamos opiniones al respecto entre un webmaster, una Googler y yo en el foro para webmasters de google. Si te interesa verlo,
mirá el post acá.
Éxitos!