para ser sincero yo no e usado el que mencionas simpre he utilizado el que viene con el microsoft visual estudi 6.0, el del 2005 apenas e empesado ver como funciona y la verdad todavia no lo he visto pero si usas el del 6.0 es bastante sencillo, t crea el instalador, como queires llamar al programa etc..
recuerda que para el 6.0 es el que esta en >>Herramientas de Microsoft Visual Studio 6.0 >> Asistente para empaquetado y distribución. bueno me avisas si es lo que buscabas.