Hecho, muchisimas gracias a los dos, cada uno por su aporte, detección del problema y solución :O
Gracias DragonX por el ultimo comentario tambien, sabia lo que era el ID, pero al no tener un ID agregado anteriormente para #cse-search-box en mi hoja de estilos me ha hecho confundir bastante, pero ahora creo que lo entiendo, en el mismo codigo que te facilita google te crea una ID y le pone sus parametros, sin tener que recurrir a la hoja de estilos de mi web, y al haber metido otra con la misma id pues me dió el problema, ahora digo yo....si le hubiera cambiado el nombre a la ID de ese buscador en concreto directamente del codigo de google?, hubiera validado y funcionado tambien?...responder a estas preguntas si quereis jeje, que ya me habeis ayudado bastante :)
Saludos y suerte