Con LocalConnection puedes comunicarte entre películas flash. Así podrías mandarle un mensaje desde el swf del popup al de la web para que esta vaya al apartado correspondiente.
http://www.cristalab.com/tutoriales/...onnection.html http://www.tutoriales-flash.com/tutorial.asp?id_tuto=11
Una pregunta:
Y si, en vez de abrir una ventana nueva con todo el engorro que supone para el usuario.... haces un popup en flash, dentro de la pelicula original??.
Solo tienes que hacer un movieclip con un boton de cerrar...