Problema .htaccess

[desinglive]

Hola tengo una programacion php, y compre ayer un server y un dominio, la compañia donde contrate todo decia que el archivo .htaccess. estaba incluido osea q se puede usar ese archivo, pero al subir mi programacion y conectarla a la base de datos, entra bien en la web , pero cuando daba a registro, o enviar descarga no funcionaba.... que puedo hacer? la programacion esta correcta y el .htaccess tambien.

en el directorio public_html sale un archivo .HTACCESS que contiene lo siguiente:
# -FrontPage-

IndexIgnore .htaccess */.??* *~ *# */HEADER* */README* */_vti*

<Limit GET POST>
order deny,allow
deny from all
allow from all
</Limit>
<Limit PUT DELETE>
order deny,allow
deny from all
</Limit>
AuthName livetorrent.es
AuthUserFile /home/livetorr/public_html/_vti_pvt/service.pwd
AuthGroupFile /home/livetorr/public_html/_vti_pvt/service.grp

no se que sera...

y luego el que tengo dentro de la carpeta WEB es el de la prog,

un saludo y gracias