Hola:
Si conoces algún editor de imágenes que genere ficheros que no sean cuadrados, pásanos ese dato...
Las imágenes hexagonales puedes crearlas con una parte hexagonal visible dentro de una caja invisible... los fondos invisibles solo pueden crearse con ficheros gif o png... justamente el enlace que te pasé crea formas poligonales (y circulares o cuadradas) en una imagen cuadrada transparente, además de crear el tag mapa y los tags areas necesarias para crear el efecto rollover.
Tal vez no viste bien la página, o no te entendí.
Saludos