pues seria mas facil por ftp pero pues cada quien, otra cosa, algunas veces el IIS viene configurado para limitar el tamaño de archivos a 4mb, en algunos host esta asi, tendrias que checar si esta ese limite para que no te corte la subida
checa esta pagina:
http://msdn.microsoft.com/es-es/library/aa479405.aspx
abajo de la Figura 3 lo que dice sobre lo que te comento, suerte