Ruta absoluta muestra la página, ruta relativa no

[venkman]

En general será algo que afecte a ambas cosas. Lógicamente los enlaces hay que cambiarlos, pero también habrá que modificar alguna parte del código para que esas URLs se entiendan. Dependiendo de lo complejo de tu aplicación puede que esto segundo se limite a crear un fichero .htaccess apropiado, o a hacer tú mismo un sistema basado en URLs amigables.