Hola, yo llevo poco con Xoops, pero lo que he visto porque también a mi no me indexaba partes, es lo siguiente:
En Xoops tiene que haber enlaces de todos los modulos que tengas, porque sino el googlebot no se aclara.
En tu web estás poniendo enlaces de selecciones, equipos etc, y eso son las ramas, pero tienes que poner esto en algún sitio, como si es en una esquina escondido
http://yotufutbol.com/modules/mastop_publish/ eso es la raiz de el modulo mastop_publish, y google al entrar por ahí pues ya comprenderá el resto del modulo.