Hola:
La organización de tu código, en principio no debe dar problemas, siempre que no pretendas usar un código aún no "visible", ni lo re-escribas... aunque eso de usar jquery... en principio no creo que haya problemas, pero debes consultar las condiciones de uso. No creo que haya que mover el mensaje, pero si no lo resuelves, danos un toque para moverlo al foro frameworks.
Saludos