supongamos que el contenido de fckeditor es:
<div id="hola">dasdasd</div>
cuando metas esto dentro del oculto saldra
<input type="hidden" value="<div id="hola">dasdasd</div>">
si te das cuenta el value se esta cortando cuando abres el id del div ¿o no?
seguan el manual de php para la funcion:
htmlentities() tienen el siguiente ejemplo:
$str = "A 'quote' is <b>bold</b>";
// Outputs: A 'quote' is <b>bold</b>
echo htmlentities($str, ENT_QUOTES);
asi las comillas son reemplazadas y por lo tanto no cerraran to etiqueta html...