En primer lugar gracias por la rápida respuesta. Seguro que este tema será util para más de uno ya que el tema SEO es complicado.
1º Entiendo entonces que si doy de alta una URL en Google.es, todos los los archivos en español e inglés serán indexados por GOOGLE, y mostrará resultados pertinentes en todos los países donde las búsquedas tengan relación con las palabras de los archivos indexados. ¿ESTO ES ASÍ? Eso es muy positivo porque con solo 1 alta haces todo el trabajo a escala mundial. De hecho con hacer un Sitemap e indicar su ubicación en el archivo robots.txt ya está gran parte del trabajo hecho
2º Supongo que Yahoo y MSN es parecido en la forma de indexar contenidos. ¿O NO? De todas formas, sobre el tema de los idiomas y los buscadores en general, sé que lo ideal es trabajar con dos URLs por separado, pero en los casos en los que por diferentes motivos se utilice una sola URL que muestre la página en español y tenga un link a un subdirectorio en otro idioma, como bien se ha dicho en principio los buscadores NO deberían de ignorar el SUBDIRECTORIO.
3º ¿Afecta mucho a la indexación para el extranjero si no se pone el xml lang, el meta language, y el meta country? Porque en principio las frases clave de cada archivo deberían ser indexadas y según las búsquedas, mostradas. Pero por lo que me comentáis parece importante no olvidar ese detalle
4º ¿Cual es vuestra experiencia con las altas en Open Directory Project, Directorio de Yahoo! y Biblioteca Virtual WWW? Para algunos temas parece que no hay cabida. Y de resto dicen que solo se puede hacer 1 envío. Pero en el caso de una web multilingüe supongo que permiten el envío a las 2 secciones según idioma. Otra cosa es que te denieguen la inclusión :-/
Bueno, espero me aclaréis esos pequeños cabos sueltos y nuevamente gracias por tan buenas respuestas que sin duda serán de utilidad para más de uno en un tema tan amplio como este.