checkea solo rut Madre!

[gerortiz]

lo que pasa es que es un poco mas complejo que eso, ya que los datos que imprime son directamente de la base de datos osea un trozo del codigo para que mas o menos entiendas:
Este es el codigo select donde trae los datos:
$queryeje = "select Rut_Madre,RUT,RZ_Hija,rz_madre, Ejecutivo from marketing..clientesV2 where rut_madre='".$rut_madre."' order by RZ_Hija";
$rs=mssql_query($queryeje);

luego listo todos los datos:


while ($column=mssql_fetch_array($rs))
{
$matrizcli[$ind][0] = trim($column["RUT"]);
$matrizcli[$ind][1] = trim($column["RZ_Hija"]);
$ind++;
}
for($i=0; $i<count($matrizcli); $i++)
{
echo'<tr>';
echo'<td><input id="rut_a" name="rut_a[]" type="checkbox" value="'.$matrizcli[$i][0].'"</td>';
echo'<td valign="top">'.$matrizcli[$i][0].'</td>';
echo'<td valign="top">'.$matrizcli[$i][1].'</td>';
}
}

el rut trae todos los rut, (rut_madre, rut_hijas), entonces no se como filtrar y que solo me checkee el rut madre