En el javascript debería ser asi:
Código:
..
....
mypage += "?param1='uno'¶m2='dos'¶m3='tres'";
window.open(mypage,myname,settings);
En PHP debería ser algo asi...
Código:
param1 = $_POST['param1'];
param2 = $_POST['param2'];
param3 = $_POST['param3'];