¿tienes los archivos del lightbox en tu carpeta root (raíz)? lo mas seguro que es un problema de tus rutas. has una carpeta dentro de tu root llamada 'js' (sin comillas) y pon ahí los archivos:
prototype.js, scriptaculous.js y lightbox.js.
Y otra carpeta llamada 'css' y dentro por el archivo:
lightbox.css
Entonces cambia el código que tienes por este:
Código HTML:
<link rel="stylesheet" href="css/lightbox.css" type="text/css" media="screen" />
<script type="text/javascript" src="js/prototype.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/scriptaculous.js?load=effects"></script>
<script type="text/javascript" src="js/lightbox.js"></script>