ejecutar código javascript

[maitep]

hola compañeros del foro.

tengo un codigo el javascript que funciona como una marquee, la cosa es que ese código me empieza a funcionar una vez cargada la pagina
pero resulta que la pagina se actualiza siempre cada x tiempo porque tiene que actualizar unos datos,
he probador poner el tiempo de recarga mas tarde pero igual sigue sin funcionar

como puedo resolver el problema??? se puede cargar el javascript sin que la pagina se haya cargado del todo.

muchas gracias