Ese es uno de los problemas con todos los gestores de contenidos, sobre todo con los de eCommerce. Por esto es que recomiendo siempre hacer los desarrollos a medida, pues por más que sea Opens Source, la complejidad del código impide modificarlo cómodamente.
Para este problema específico, hay algunos módulos que te permiten utilizar las funciones específicas para ECommerce de google analytics.
En caso de osCommerce, puedes ver
esta y
esta.
saludos!