Si se puede instalar linux en PC! de hecho pueden coexistir varios Windows y Linux en un mismo disco duro por medio de las particiones...
bueno el caso es k si ya vas a instalar el linux mete el disco de instalacion de tu linux y ahi puedes manejar las particiones que quieres tener asi como su tamaño (todos los linux lo tienen), y dejar lo restante a tu windows...
y si ya nomas vas a dejar windows, pues con el disco de arranque que tienes, con k te deje el prompt de c: tienes ya k despues te metes a tu unidad de cd y corres el archivo de instalacion (en el 98 creo k era instalar.exe o parecido) y ya hace la particion automaticamente, sin necesidad de meter mano con fdisk (a menos k asi kieras claro)...
Saludos!
(por cierto esto va en sistemas operativos
)