Eso es porque el PCIe 2.0 es mas rapido que el 1.1 ó PCIe a secas ya que tiene mas ancho de banda (16 GB/s del 2.0 vs 8 GB/s del 1ero), y como esas tarjetas son mas potentes, no van a poder usar todo su potencial. Eso se traduce en menos FPS.
Y no necesitas un CPU de 4 nucleos, sino una placa base con PCIe 2.0
Salu1+1