intenta de esta manera
Código PHP:
$TEMPLATE["FOOTER"] = <<<EOF
<p>
// aqui tengo un anuncio google
</p>
</div>
</div>
</td>
</tr>
</table>
include("../pie1.php");
include("../pie2.php");
</center>
// aqui tengo un anuncio google
</body>
</html>
EOF;
si te fijas, le quite
<?php ?> que rodea los includes ya que el contenido de $TEMPLATE["FOOTER"] = <<<EOF es código php.
saludos.