la primera recomendación, como ya te dijeron, es que un tema de estos sea abierto en css.
Respecto a tu pregunta es conocido que Internet Explorer tiene utiliza medidas diferentes a Mozilla pero bueno la sugerencia es aprovechas que IE no cumple con los estándares de comentarios en css y hagas una hoja de estilos algo así:
Código:
...
heigth: 100%;
//heigth: 98%;
...
IE tomará el segundo ya que al no respetar el comentario sobreescribe el atributo, otra opción es cambiar el 100% por auto