Hola!
Me parece que no has revisado detenidamente el código de WP-Cache, si ves en wp-cache-phase1.php
linea #49 con la función readfile ($cache_file) se imprime el archivo de cache, y en la linea #50 hay una llamada a
die que termina al ejecución del script, en ese punto Wordpress ya no sigue cargando y termina el proceso.
Si no fuera así y wp-cache no terminara la ejecución de Wordpress no habría una mejora tan notable usandolo :)