Buena costumbre 'include_once'

[Mort20]

Depende de lo que quieras. El include ya sabes que no necesariamente incluye únicamente funciones y clases, también puede ejecutar código automáticamente en el momento de incluirlo. Si ese código lo hay y necesitas llamarlo en esas ramas cada vez porque las anteriores no te sirven, obviamente debes hacer un include();
Sin embargo si es sólo clases o funciones, con una vez que se incluyan basta. La replicación de datos en este caso es absurda.

Además, en el primer caso sería mejor intentar incluir en una función esas partes del script que deben ejecutarse sí o sí, así sólo la llamas y puedes ahorrarte hacer includes cada vez. Puede ser que eso no te vaya bien, entonces intenta separarlo en otro fichero que vayas incluyendo replicando sólo los datos necesarios.

En resumen: el include o require sólo cuando no queda más remedio que replicar ciertos datos.