Para saber si es .avi o .mov puedes usar esta función (preg_match()) :
Código PHP:
$bool = preg_match('/(\.avi|\.mov)$/',$nombre); //$nombre es el nombre de archivo
$bool es 0 (no coincide) o 1 (coincide).
Puedes saltarte eso e hacer directamente "if(preg_match(...))"