Me parece que no me estás leyendo con atención:
- Que esté deshabilitado el uso de variables globales es correcto, por consiguiente no debes cambiar nada en el php.ini
- Las variables globales no se deben usar más, PHP5 viene con su configuración por defecto así, y PHP6 ya no podrás siquiera volverlo atrás.
- Debes usar SIEMPRE los arrays GET, POST o REQUEST, no es opcional.
¿Se entendió?