Así es todos aquellos HTML que se vean afectados por el template se van a ver modificados.
En el template te vas a encontrar con zonas editables (esas son las que una vez aplicado el template al HTML vas a poder modificar) y las zonas libres (esas na vez aplicado el template al HTML no las podés modificar). Estas últimas son las que si modificas, se modifican en todos los HTML's dependientes.