se me ocurre, (ya que yo tengo ahorita un problema con un SATA y una tarjeta PCI) pero talvez te de una luz.
En los drivers de la tarjeta PCI vienen los drivers para casi todas las MB, deberas buscar ahi tu MB sacar los drivers y ponerlos en diskette para poder instalar win... lo que no se es si vendran las MB que no tienen integrado SATA asi que espero te ayude un poco.