No te enredes

solo haz dos querys...
Me explico, supongamos que vienen los datos 1, 2, 3, 4, 5 y 6.
Los tres primeros van a una tabla y los tres últimos a otra. Ahora solo haces dos querys.
INSERT into TABLA1 (campo1, campo2, campo3) VALUES (1, 2, 3);
INSERT into TABLA2 (campo1, campo2, campo3) VALUES (4, 5, 6);
Inténtalo y nos cuentas.
PD: Obviamente esto es solo un ejemplo