Otra manera: en el archivo que necesitás que cargue primero, agregás estas líneas:
Código PHP:
var include=function(){
return function(Src){
var sc=document.createElement('script');
sc.type='text/javascript';
sc.src=Src;
document.getElementsByTagName('body')[0].appendChild(sc);
sc=null;
}
}();
window.onload=function(){
include('1.js');//llamada al segundo archivo
}