Beto, al insertar el swf en el html colocale el siguiente parámetro en el código de inserción del mismo:
<param name="wmode" value="transparent">
Si usas Dreamweaver, seleccionando el swf, en la ventana de propiedades, presioná sobre "parameters" y en la ventana que se te abre a la izquierda ponés "wmode" y a la derecha "transparent"