Prueba reemplazando los apostrofes por su equivalente en HTML:
Código:
area = new HyperTextArea("content", '<%= Replace(content, "'", "& #39;")%>', 520, 200,"");
Saludos
Edit: En el segundo termino de la funcion, tuve que separar el ampersand (&) del "palm sign" (#) pero va todo junto.