Lo que te recomiendo es que crees el Sitemap completo, incluyendo todos los enlaces de tu Sitio, de esta forma la indexación será más completa. Lo que puedes realizar en el caso que quieras destacar alguna sección en particular es utilizar el parámetro
priority en el Sitemap, con esto lograrás establecer una cierta prioridad de indexación.
Una muy buena herramienta para crear Sitemaps es
http://www.xml-sitemaps.com/. Puedes optar por crearlo de esta manera y luego modificar los parámetro
priority a tu gusto.
Un saludo,
Gabriel