No depende de una tarjeta de video, el problema que tienes es que además cambias de formato de AVI a MPEG, eso siempre es más pesado, si fuera cambio de codec AVI-AVI sería rápido, pero AVI a MPEG es más lento... De los programas de conversión más rápidos que conozco, el TMPGEnc 4.0 Express... El programa ayuda mucho, pero el procesador es el que se lleva el trabajo pesado, un procesador veloz o multi core hará la tarea más rápido... El TMPGEnc te permite usar los nucleos que tengas y es aún más rápido