Quitarse el concepto de que PHP haces páginas!. include() incluye código PHP, no páginas, que en ese código PHP imprimas código HTML (que sí hace páginas) es otro asunto.
Tu problema no es con PHP, es con el HTML generado, importa poco si lo incluyeses o lo imprimieras todo en un solo archivo. Checa ese código, pregunta en el foro correspondiente.
Suerte
