no entiendo eso de hacer consultas segun la hora, si a lo que te refieres es que se hagan automaticamente, PHP no lo puede hacer, necesitas un Corn Job para eso, que se hace en sistemas Linux (segun tengo entendido)
pero si lo que quieres es hacer una consulta que te devuelva datos dependiendo de un campo hora, lo puedes hacer como harias cualquier otra consulta
Código PHP:
<?php
$sql = mysql_query("SELECT * FROM tabla WHERE hora = '15:25'")
?>
algo asi
saludos y suerte