ok,
por ejemplo, yo subo el archivo "mundo de noticias" y es el primero.
entonces en la base de datos, insertas este y el numero 1
ahora, para la ruta, en el link
echo "<a href='/pdf_soporte/$nombre'.pdf>";
esto es en tu archivo que quieres mostrar, donde nombre es el dato que obtienes de la base de datos al hacer la consulta.
Ahora en el upload de los archivos:
primero obviamente se cargan los datos del archivo mediante un form..
luego lo envias a un archivo php, que es donde se procesa el pdf, antes de finalizar el script, haces una consulta a tu tabla, con "select count(*) as total from soporte" para obtener el total de articulos.
Como el nombre del archivo lo tienes en una variable, sabemos cual es el que vamos a renombrar, así que aplicamos lo siguiente:
rename("/pdf_soporte/$nombre_del_archivo", "/pdf_soporte/$total"."pdf");
espero me hayas entendido,, lo haría funcionar, pero no tengo instalado por el momento ni apache ni php, te he contestado en base a experiencia.